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農家肥是農戶將人畜糞便以及其它原料加工而成的，常見的有廄肥、堆肥、沼氣肥、熏土和草木灰等。收獲植物及其加工殘物也是一類具有較好應用價值的農家肥，其中大豆餅、棉籽餅等餅粕類養分含量比較高，特別是氮都在5%以上。水溶性肥料是一個速肥料，可以讓種植者較快地看到肥料的效果和表現，隨時可以根據作物不同長勢對肥料配方作出調整。稻草和秸稈養分較低，一般總養分在2%-3%。綠肥是利用其植物體的全部或部分作為肥料。常用的綠肥作物有紫云英、苜蓿、豌豆、毛苕子和紫穗槐等。

化肥歷來是農作物增產的重要因素，對我國糧食增產的貢獻率高達40%。化肥在總肥料投入量的比重大大增加，特別是氮素養分比重超過有機肥，但有機肥在磷、鉀養分供應上仍占主要地位。然而，長期以來化肥施用不合理，給耕地質量帶來了一系列的問題，化肥實際利用率不足30%，土壤污染問題嚴重，污染事故頻發，全國耕種土地面積的10%以上已受重金屬污染，其中華南部分城市約有一半耕地遭受鎘、申、工等有毒重金屬和石油類有機物污染。伴隨著這些問題的出現，新型肥料應運而生。

生物肥料的特點：微生物肥料是一類活菌制品，它的效能無不與其菌類活性及使用方法有直接的關系。（1）微生物肥料的核心是指品種特定的有效的活微生物，任何一款產品的有效活菌數都有明確的規定，有效活菌數降到一定數量時，它的作用也就沒有了。（2）微生物肥料是一類農用活菌制劑，從生產到使用都要注意給產品中微生物一個生存的合適環境，主要是水分含量、酸堿度、溫度、載體中殘糖含量、包裝材料等等。施用有機肥料能改善土壤結構，有效地協調土壤中的水、肥、氣、熱，提高土壤肥力和土地生產力。（3）微生物肥料作為活菌制劑有一個有效期問題。此類產品剛生產出來時活菌含量較高，但隨著保存時間和不同的運輸、保存條件的變化，產品中的有效微生物數量逐漸減少，當減到一定數量時其有效作用顯示不出來。因此，規定產品的有效期和正確使用意義重大。（4）意適用作物和適用地區，是保證微生物肥料有效作用的重要保證。提倡有針對性地選育生產均種，例如針對堿性土壤、酸性土壤的均種，或是針對某特定作物的均種。