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進樣器的維護給樣機可分為手動和自動兩種，盡管它們的工作方式不同，但其使用要點基本相同。自動進樣器常見的問題是交叉污染，造成交叉污染的原因非常直接，樣品在進樣針的內外表面都殘留著樣品，然后再進入色譜系統。要解決交叉污染，主要靠清潔。2、操作精細，手動進樣器的操作要領大致相同，應使用液相色譜 LC進樣針，進樣時要插到針頭，不使用時要將針頭留在進樣器內，在使用前后要及時清洗。

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色譜柱維護化合物分離的關鍵是色譜柱。維護好的色譜柱具有很高的塔板數量，儀器基線穩定。1、避免壓力、溫度急劇變化和機械振動。氣溫驟降或使色譜柱從高處落下，都會影響柱內填充狀態；柱壓突然升高或降低，也會對柱內填充物產生沖力，所以在調節流速時要緩慢進行，在閥進樣時閥的轉動不能過緩(如前面所述)。2、溶劑的組成應逐漸改變，尤其是反相色譜，不能直接由改為全水，反之亦然。3、色譜柱反沖，納譜分析小分子分離液相色譜柱 ChromCore系列和 EcoPak系列色譜柱進行反沖；納譜分析的手性色譜柱 UniChiral系列色譜柱可以反沖、反沖去除留在柱頭的雜質。而納譜分析生物大分子液相色譜柱 BioCore系列色譜柱不能反沖，否則反沖會迅速降低柱效。4、為避免破壞固定相，選擇合適的流動相(特別是 pH)。有時候，一預柱可以在進樣器前連接，分析柱是硅膠粘合時，預柱為硅膠，可使流動相在進入分析柱前先被硅膠“飽和”，避免分析柱中的硅膠基質溶解。

做好日常儀器維護，養成習慣，可大大降低故障率，減少維修及停車費用。根據儀器的硬件結構，經過流動相的順序分為：流動相溶劑瓶→在線脫氣機→高壓泵→自動/手動進樣器→色譜柱溫箱→檢測器→廢液。以下小探就儀器各部在日常使用中應注意的事項，均按此順序講。首先是溶劑瓶，大家似乎覺得溶劑瓶無非就是幾個玻璃瓶，似乎沒什么好說的。不過，這樣看起來簡單，如果不注意的話，常常會招來不少麻煩：1.1首先就是污染：要特別注意盛有水或緩沖液的瓶子，雖然液體中使用的水大多經過殺菌處理，但是，細菌的生命非常頑強，在適當的溫度和光照下，它們就會活躍起來，如果流動相中再加入磷酸鹽一類的添加劑，它們就會更加生機勃勃。因此，溶劑瓶要做的重要工作就是勤換流動相，常換常新。另一種防止細菌滋生的方法是在水中加入一定濃度的，但是，這種物質有，又有規律性，不能很好地得到，而且風險很高，所以，我認為，還是直接換一種流動相比較方便。

1.2水相要經常更換，那么有機相呢？永遠不要擔心細菌繁殖吧？是的，有機相完全不用擔心，但是如果是裝的瓶子，要特別小心的“聚合”，在自然條件下，特別是各種光照條件下，分子就會和周圍的朋友手拉手，小團體就會慢慢地“聚合”起來。為防止聚合的發生，要特別注意裝應使用茶色的溶劑瓶，避免陽光直射，以及在更換時，一定把瓶底剩余的倒掉換新的。

如果換下來的是灰黑色的，這是常見的情況，這是由于泵頭密封墊磨損造成的，如果出現頻繁更換白頭切替換下來的都是灰黑色的，這是常見的情況，這是因為泵頭密封墊的磨損所致，如果出現頻繁更換白頭切替換下來的情況，就該講衛生了。3.3流動相替代有時會在泵的使用中出現，這種替代是指將流動相從反相溶劑替換為正相溶劑，或反過來替換為溶劑，這個過程的是與流動相的兼容性，常用的正反相色譜溶劑是不互溶的，因此在更換中間，必須用異沖洗系統，保證管路中所有的原有溶劑都不能完全溶解。

繼續往前走，到進樣器，進樣器分為手動和自動兩大類，雖然它們的工作方式不同，但要點基本相同：4.1自動進樣器常見的問題是臟，用術語稱其為交叉污染，交叉污染產生的原因非常直接，樣品在進樣針/外表面殘存，并且在下一個進樣進入色譜系統時，要解決交叉污染，也很簡單，就是洗，自動進樣器都會有洗針的功能，如果樣品濃度較高，就會有洗針的功能。如忘了開啟洗針功能，可能會殘留在針座或流通閥上，此時要將這兩個部件清洗，需要按照說明書上的維修步驟將這兩個部件拆開超聲清洗。4.2在自動進樣器中還出現了峰面積重新生成的問題。一般這是因為自動進樣器在吸樣品時有問題，首先要觀察樣品的液面是否夠高，以保證進樣器能被吸進；如果排除了這個問題，要看一下自動進樣器的設置，對于一些粘度大的樣品，要降低自動進樣器的吸收速度，這個時候要看一下樣品瓶的吸入量；當然，還有一些比較少見的問題：樣品被吸附在樣品瓶上，此時要考慮更換樣品瓶；還有一種情況，是因為樣品瓶的瓶蓋擰緊太緊，所以這個時候要考慮把瓶蓋擰松。