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圍繞內部控制度開展審計

圍繞主要經濟指標和經營目標完成情況開展審計。通過大量認真細致的實質性測試，核實確認企業上級單位及本企業制定的經營目標是否實現，產值、成本、利潤等經濟指標是否完成，有無潛虧和虛報、瞞報指標的現象，進而衡量被審計對象履行職責的情況，評價其業績。 圍繞內部控制制度開展審計。主要審查被審計單位是否按照國家法律、法規精神，結合本單位的實際制定了科學健全的內部控制制度，其執行是否嚴格、有效，有無失控點，有無因制度不健全或執行不力而發生違規的問題，對發現的問題是否及時采取措施加以改進等。

審計實施方案中所確定的審計目標、范圍、內容和審計重點應符合審

審計實施方案中所確定的審計目標、范圍、內容和審計重點應符合審計工作方案要求，確定的審計方法、方式等應當科學、合理、可操作。但這畢竟只是事前的一個指導方案。在審計實施過程中根據實際情況不同，經審核同意后可作適當調整。審計實施方案的編制和調整過程中，因審計范圍、審計重點、審計內容、審計方法等確定不當，造成重大問題應當被審計而未審計，或者說預期的效果未達到，這都要采取相應的對策及措施來彌補，來完成。對與實施方案有出入的地方，都要在重要管理事項中加以說明。

企業研發人員工資薪酬在整個研發費用中占有較大比重

企業研發人員工資薪酬在整個研發費用中占有較大比重，因而，準確界定研發人員，對認定專項審計來說非常重要。但審計過程中，對企業研發人員的判定存在一定難度，有時很難判定究竟哪些人員屬于研發人員。比如，許多企業未按部門核算工資，員工聘任合同中也未注明具體崗位。又比如，一些研發人員經常參與企業的日常生產管理，往往具有雙重“身份”。企業研發人員不能準確劃分，其人工成本就容易和企業其他人員的人工成本相混淆，從而給認定審計后續工作帶來困難。

高新技術企業認定的宣傳力度不夠

高新技術企業認定的宣傳力度不夠。由此造成的情況是：一方面，不少企業誤認為高新技術企業認定的門檻較高而不敢申報。另一方面，企業對認定專項審計重視不夠、不得要領，對相關政策的了解不夠積極、主動。另外，注冊會計師不是高新技術領域方面的專家，往往無法識別費用是否真正用于研發活動，產品（服務）的生產與提供是否確實利用了高新技術。對特殊領域和涉及的技術合同，企業通常不愿提供。個別科技園區對園內企業進行不同程度的干預，向他們推薦一些“關系事務所”，造成不少會計師事務所和申請企業工作的被動。