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Tris本身呈堿性，只用Tris-HCl緩沖體系即可配制pH范圍由酸性到堿性的緩沖液，方法也較為簡單，而且還可以與其他物質組成多種緩沖體系；對生物化學過程干擾很小，也不與鈣、鎂離子及重金屬離子發生沉淀。但是，Tris緩沖液的pH值受溶液濃度和溫度影響較大，稀釋十倍，緩沖液的pH值變化大于0.1，溫度每升高一度，pH值下降0.03；同時其易吸收空氣中的CO2，所以配制的緩沖液要蓋嚴密封。

硼酸鹽：硼酸鹽與許多化合物形成復鹽、如蔗糖。

檸檬酸鹽：檸檬酸鹽離子容易與鈣結合，所以存在有鈣離子的情況下不能使用。

磷酸鹽：在有些實驗，它是酶的抑止劑或甚至是一個代謝物，重金屬易以磷酸鹽的形式從溶液中沉淀出來。而且它在pH7.5以上時緩沖能力很小。

羥：它可以和重金屬一起作用，但在有些系統中也起抑制作用。其主要缺點時溫度效應。這點往往被忽視，在室溫pH是7.8的Tris緩沖液，4℃時是8.4，37℃時是7.4，因此，4℃配制的緩沖液在37℃進行測量時，其氫離子濃度就增加了10倍。在pH7.5以下，其緩沖能力極為不理想。

   蛋白制備及純化過程中緩沖液的選擇非常重要，合適緩沖液才能保證蛋白的活性和結構穩定。

      當我們純化蛋白時，的就是要保持蛋白在純化過程中不能失活，或者是盡量降低純化過程對蛋白活性帶來的損失。這就意味著蛋白在整個純化過程中要始終保持可溶性和活性。

       因此設計一個防止蛋解和聚合的蛋白純化緩沖體系就非常重要了，尤其會凸顯在實驗結果上。在設計緩沖buffer時應考慮以下幾個因素：pH值、緩沖體系、鹽離子、還原劑和穩定劑。其中每一個因素都要根據你的目的蛋白進行優化，并以目的蛋白的活性作為優化的評估標準。