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1.識別和清除外來的抗原，如病原微生物等。這種防止外界病原體和清除已病原體及其他有害物質的功能被稱之為防御。使人體免于病毒、細菌、污染物質及疾病的攻擊。

2.識別和清除體內發生突變的細胞、衰老細胞、細胞或其他有害的成分。這種隨時發現和清除體內出現的“非己”成分的功能被稱之為監視。清除新陳代謝后的廢物及細胞與 病毒打仗時遺留下來的病傷，都必須藉由細胞加以清除。

3.通過自身耐受和調節使系統內環境保持穩定。修補細胞能修補受損的和組織，使其恢復原來的功能。健康的系統是無可取代的，但仍可能因為持續攝取不健康的食物而失效。

      常見益生菌主要指兩大類乳酸菌群：一類為雙歧，常見的有嬰兒雙歧、長雙歧、短雙歧、青春雙歧等；除了通過食物獲取益生菌，新鮮的蔬果中也含有各種益生元，保證每天吃1斤蔬菜，吃200～350克水果就能給腸道有益菌提供豐富的食物。另一類為乳，如嗜酸乳、干酪乳、鼠李糖乳、植物乳和羅伊氏乳等。應用于人體的益生菌有雙歧、乳、芽孢和酵母菌等。從安全性考慮，目前工業用益生菌主要來源于健康人體、動物和傳統食物（發酵乳制品、泡菜、納豆等發酵食品）。      益生菌是一類對宿主有益的活性微生物，是定植于人體腸道、生殖系統內，能產生確切健康功效從而改善宿主微生態平衡、發揮良好作用的有益活性微生物的總稱而益生菌對我們的身體健康有著至關重要的作用。

         自90年代初以來，形形色色的“益生菌”類風靡了整個世界。與此同時，“益生菌”的研究業已成為國際上的熱門研究課題。何謂益生菌？空腹時胃酸酸性強，而飯后半小時食物中和了部分胃酸，利于更多益生菌活著通過胃。國際營養學界普遍認可的定義是：益生菌系一種對動物有益的細菌，它們可直接作為食品添加劑服用，以維持腸道菌叢的平衡。  在國外已開發出數以百計的益生菌保健產品，其中包括：含益生菌的酸牛奶、酸乳酪、酸豆奶以及含多種益生菌的、、、粉末劑、抑菌噴劑等等。針對人研究的不多，國內對益生菌的認知度還不是很強，這使得益生菌的產品線應用還不是很廣泛，因為存活率就是一大技術難題。

    　  通過一系列人體腸道內實驗，科學家發現，許多人的消化道阻止了標準益生菌對其進行“殖民”。此外，服用益生菌平衡副作用，可能會延緩正常腸道細菌和基因表達回歸初始狀態。兩篇相關于美國東部時間9月6日發表在《細胞》雜志上。

　　“人們十分青睞益生菌，盡管針對益生菌的文獻是非常有爭議的。”通訊作者、以色列魏茨曼科學研究所學家Eran Elinav在接受《中國科學報》記者采訪時表示，令人驚訝的是，研究顯示許多健康志愿者對益生菌有抵抗力，這些細菌不能“占領”他們的胃腸道。酵母菌：目前研究發現酵母菌具有調節腸道平衡、促進飼料轉化以及提高機體功能等良好的益生特性，多作為飼料添加劑用于畜禽養殖。