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微生物飼料添加劑是指利用動物體內正常微生物及其代謝產物或生長促進物質經特殊加工工藝制成的制劑，它具有補充、調整或維持動物腸道內微生態平衡，達到防病，促進健康或提高生產性能的目的。微生物飼料添加劑既包括正常微生物成員，尤其是優勢苗群，還包括一些能促進正常微生物群生長繁殖的物質所制備的制劑，能產生一定的生物效應或生態效應。

根據國家和產業發展需求，研究產業技術進步和結構調整急需的關鍵共性技術，如微生物分子改良、重組基因的表達、目標物的分離純化、化學合成等技術，建立可保障持續創新能力的研發技術平臺，提高生物飼料產業的自主創新能力。

以市場為導向，把握飼料行業和生物飼料產業的技術發展趨勢，對具有重要市場價值的重大科技成果如飼用酶制劑、微生態制劑、酵母發酵物、植物提取物等進行完整的工程化和系統集成化研究開發，消化、吸收和集成創新引進的先進技術，完成產業化開發的全過程，形成適合于規模化生產的成套成熟的工程化研究成果。

發酵飼料采用微生物菌發酵配合飼料或飼料原料，人為控制水分、發酵溫度、發酵時間及氧氣含量等條件，通過微生物自繁和代謝產生益生菌和功能性代謝物。發酵飼料分為液體飼料和固態飼料，其營養特性取決于底物、發酵菌和發酵條件等因素。選擇菌一般遵循的原則：①菌及其代謝產物要安全；②作用效率要符合生產需要；③菌的性能穩定且不易發生變異。

飼料在發酵的過程中，微生物區系平衡被打破后，益生菌在特定情況下有可能會轉變為病原菌，如乳酸桿引起的臨床生病。因此發酵飼料的使用應充分考慮動物、消費者以及環境等因素安全方面的問題，經過嚴格的科學試驗確認其無害后才能推廣應用。微生物發酵飼料中的大部分有益菌是活菌，而抗生具有殺菌作用，因此二者也不能同時使用。