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這一理論稱為能量圖景，漏斗下方的凹凸反映蛋白質構象瞬間進入局部自由能小區(qū)域。能量圖景的示意圖，高度代表能量尺度，寬度代表構象尺度，在漏斗（funnel）的下方存在別的低能量狀態(tài)，共存的不同能量狀態(tài)的蛋白質種類也降到小。

在鹽酸胍誘導去折疊的過程中，hFGF-1可以監(jiān)測到具有熔球體樣的折疊中間體，而nFGF-1經由兩態(tài)（天然狀態(tài)到變性狀態(tài)）去折疊，沒有檢測到中間體的存在，折疊的動力學研究也表明兩種蛋白采用不同的折疊機制。對于同一蛋白質，采用的滲透壓調節(jié)劑不同

氨基酸在水中的溶解度差別很大，例如酪氨酸的溶解度小，25℃時，100中酪氨酸僅溶解0.045g，但在熱水中酪氨酸的溶解度較大。賴氨酸和精氨酸常以鹽酸鹽的形式存在，因為它們極易溶于水，因潮解而難以制得結晶

以甘氨酸為例：摩爾甘氨酸溶于水時，溶液pH為5.97，分別用標準NaOH和HCl滴定，以溶液pH值為縱坐標，加入HCl和NaOH的摩爾數(shù)為橫坐標作圖，得到滴定曲線。該曲線一個十分重要的特點就是在pH=2.34和pH=9.60處有兩個拐點，分別為其pK1和pK2。